Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB2

KRT84, Keratin, type II cuticular Hb4, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT84Q9NSB2 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRT84Q9NSB2 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRT84Q9NSB2 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
KRT84Q9NSB2 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRT84Q9NSB2 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRT84Q9NSB2 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRT84Q9NSB2 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRT84Q9NSB2 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRT84Q9NSB2 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRT84Q9NSB2 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRT84Q9NSB2 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRT84Q9NSB2 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRT84Q9NSB2 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRT84Q9NSB2 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRT84Q9NSB2 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRT84Q9NSB2 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRT84Q9NSB2 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRT84Q9NSB2 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRT84Q9NSB2 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRT84Q9NSB2 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRT84Q9NSB2 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRT84Q9NSB2 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
KRT84Q9NSB2 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRT84Q9NSB2 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRT84Q9NSB2 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRT84Q9NSB2 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRT84Q9NSB2 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRT84Q9NSB2 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
KRT84Q9NSB2 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRT84Q9NSB2 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRT84Q9NSB2 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
KRT84Q9NSB2 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRT84Q9NSB2 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRT84Q9NSB2 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRT84Q9NSB2 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRT84Q9NSB2 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRT84Q9NSB2 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRT84Q9NSB2 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRT84Q9NSB2 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRT84Q9NSB2 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRT84Q9NSB2 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRT84Q9NSB2 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRT84Q9NSB2 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRT84Q9NSB2 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRT84Q9NSB2 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRT84Q9NSB2 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
KRT84Q9NSB2 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
KRT84Q9NSB2 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
KRT84Q9NSB2 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRT84Q9NSB2 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRT84Q9NSB2 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRT84Q9NSB2 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRT84Q9NSB2 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRT84Q9NSB2 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
KRT84Q9NSB2 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRT84Q9NSB2 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRT84Q9NSB2 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRT84Q9NSB2 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
KRT84Q9NSB2 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRT84Q9NSB2 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRT84Q9NSB2 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRT84Q9NSB2 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
KRT84Q9NSB2 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRT84Q9NSB2 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
KRT84Q9NSB2 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRT84Q9NSB2 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRT84Q9NSB2 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
KRT84Q9NSB2 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRT84Q9NSB2 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
KRT84Q9NSB2 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRT84Q9NSB2 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRT84Q9NSB2 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRT84Q9NSB2 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRT84Q9NSB2 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRT84Q9NSB2 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRT84Q9NSB2 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRT84Q9NSB2 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRT84Q9NSB2 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRT84Q9NSB2 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRT84Q9NSB2 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRT84Q9NSB2 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRT84Q9NSB2 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRT84Q9NSB2 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRT84Q9NSB2 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRT84Q9NSB2 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRT84Q9NSB2 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRT84Q9NSB2 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRT84Q9NSB2 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRT84Q9NSB2 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRT84Q9NSB2 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
KRT84Q9NSB2 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRT84Q9NSB2 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRT84Q9NSB2 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRT84Q9NSB2 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRT84Q9NSB2 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRT84Q9NSB2 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRT84Q9NSB2 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRT84Q9NSB2 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRT84Q9NSB2 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRT84Q9NSB2 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms