Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX5

SERINC1, Serine incorporator 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC1Q9NRX5 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SERINC1Q9NRX5 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SERINC1Q9NRX5 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SERINC1Q9NRX5 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SERINC1Q9NRX5 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SERINC1Q9NRX5 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SERINC1Q9NRX5 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SERINC1Q9NRX5 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SERINC1Q9NRX5 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SERINC1Q9NRX5 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SERINC1Q9NRX5 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SERINC1Q9NRX5 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SERINC1Q9NRX5 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SERINC1Q9NRX5 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SERINC1Q9NRX5 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SERINC1Q9NRX5 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SERINC1Q9NRX5 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SERINC1Q9NRX5 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SERINC1Q9NRX5 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SERINC1Q9NRX5 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SERINC1Q9NRX5 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SERINC1Q9NRX5 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SERINC1Q9NRX5 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SERINC1Q9NRX5 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SERINC1Q9NRX5 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SERINC1Q9NRX5 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SERINC1Q9NRX5 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SERINC1Q9NRX5 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SERINC1Q9NRX5 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SERINC1Q9NRX5 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SERINC1Q9NRX5 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SERINC1Q9NRX5 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SERINC1Q9NRX5 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SERINC1Q9NRX5 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SERINC1Q9NRX5 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SERINC1Q9NRX5 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SERINC1Q9NRX5 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SERINC1Q9NRX5 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SERINC1Q9NRX5 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SERINC1Q9NRX5 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SERINC1Q9NRX5 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SERINC1Q9NRX5 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SERINC1Q9NRX5 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SERINC1Q9NRX5 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SERINC1Q9NRX5 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SERINC1Q9NRX5 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SERINC1Q9NRX5 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SERINC1Q9NRX5 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SERINC1Q9NRX5 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SERINC1Q9NRX5 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SERINC1Q9NRX5 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SERINC1Q9NRX5 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SERINC1Q9NRX5 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SERINC1Q9NRX5 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SERINC1Q9NRX5 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SERINC1Q9NRX5 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SERINC1Q9NRX5 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SERINC1Q9NRX5 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SERINC1Q9NRX5 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SERINC1Q9NRX5 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SERINC1Q9NRX5 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SERINC1Q9NRX5 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms