Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TIMMDC1Q9NPL8 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TIMMDC1Q9NPL8 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TIMMDC1Q9NPL8 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TIMMDC1Q9NPL8 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TIMMDC1Q9NPL8 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TIMMDC1Q9NPL8 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TIMMDC1Q9NPL8 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TIMMDC1Q9NPL8 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TIMMDC1Q9NPL8 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TIMMDC1Q9NPL8 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TIMMDC1Q9NPL8 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TIMMDC1Q9NPL8 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TIMMDC1Q9NPL8 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TIMMDC1Q9NPL8 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TIMMDC1Q9NPL8 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TIMMDC1Q9NPL8 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TIMMDC1Q9NPL8 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TIMMDC1Q9NPL8 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TIMMDC1Q9NPL8 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TIMMDC1Q9NPL8 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TIMMDC1Q9NPL8 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TIMMDC1Q9NPL8 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TIMMDC1Q9NPL8 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TIMMDC1Q9NPL8 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TIMMDC1Q9NPL8 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TIMMDC1Q9NPL8 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TIMMDC1Q9NPL8 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TIMMDC1Q9NPL8 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TIMMDC1Q9NPL8 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TIMMDC1Q9NPL8 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TIMMDC1Q9NPL8 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TIMMDC1Q9NPL8 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TIMMDC1Q9NPL8 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TIMMDC1Q9NPL8 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TIMMDC1Q9NPL8 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TIMMDC1Q9NPL8 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TIMMDC1Q9NPL8 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TIMMDC1Q9NPL8 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TIMMDC1Q9NPL8 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TIMMDC1Q9NPL8 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TIMMDC1Q9NPL8 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TIMMDC1Q9NPL8 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TIMMDC1Q9NPL8 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TIMMDC1Q9NPL8 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TIMMDC1Q9NPL8 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TIMMDC1Q9NPL8 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TIMMDC1Q9NPL8 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TIMMDC1Q9NPL8 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TIMMDC1Q9NPL8 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TIMMDC1Q9NPL8 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TIMMDC1Q9NPL8 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TIMMDC1Q9NPL8 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TIMMDC1Q9NPL8 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TIMMDC1Q9NPL8 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TIMMDC1Q9NPL8 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TIMMDC1Q9NPL8 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TIMMDC1Q9NPL8 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TIMMDC1Q9NPL8 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TIMMDC1Q9NPL8 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TIMMDC1Q9NPL8 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TIMMDC1Q9NPL8 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TIMMDC1Q9NPL8 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TIMMDC1Q9NPL8 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TIMMDC1Q9NPL8 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TIMMDC1Q9NPL8 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TIMMDC1Q9NPL8 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TIMMDC1Q9NPL8 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TIMMDC1Q9NPL8 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TIMMDC1Q9NPL8 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TIMMDC1Q9NPL8 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TIMMDC1Q9NPL8 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TIMMDC1Q9NPL8 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TIMMDC1Q9NPL8 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TIMMDC1Q9NPL8 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TIMMDC1Q9NPL8 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TIMMDC1Q9NPL8 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TIMMDC1Q9NPL8 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TIMMDC1Q9NPL8 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TIMMDC1Q9NPL8 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TIMMDC1Q9NPL8 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TIMMDC1Q9NPL8 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TIMMDC1Q9NPL8 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TIMMDC1Q9NPL8 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TIMMDC1Q9NPL8 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TIMMDC1Q9NPL8 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TIMMDC1Q9NPL8 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TIMMDC1Q9NPL8 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TIMMDC1Q9NPL8 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TIMMDC1Q9NPL8 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TIMMDC1Q9NPL8 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TIMMDC1Q9NPL8 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TIMMDC1Q9NPL8 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TIMMDC1Q9NPL8 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TIMMDC1Q9NPL8 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TIMMDC1Q9NPL8 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TIMMDC1Q9NPL8 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TIMMDC1Q9NPL8 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TIMMDC1Q9NPL8 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms