Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
A4GALTQ9NPC4 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms