Protein–RNA interactions for Protein: Q9C099

LRRCC1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRCC1Q9C099 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRCC1Q9C099 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRCC1Q9C099 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRCC1Q9C099 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRCC1Q9C099 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRCC1Q9C099 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRCC1Q9C099 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRCC1Q9C099 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRCC1Q9C099 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRCC1Q9C099 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRCC1Q9C099 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRCC1Q9C099 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRCC1Q9C099 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRCC1Q9C099 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRCC1Q9C099 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRCC1Q9C099 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRCC1Q9C099 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRCC1Q9C099 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRCC1Q9C099 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRCC1Q9C099 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRCC1Q9C099 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRCC1Q9C099 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRCC1Q9C099 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRCC1Q9C099 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRCC1Q9C099 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRCC1Q9C099 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRCC1Q9C099 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRCC1Q9C099 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRCC1Q9C099 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRCC1Q9C099 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRCC1Q9C099 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRCC1Q9C099 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRCC1Q9C099 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRCC1Q9C099 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRCC1Q9C099 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRCC1Q9C099 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRCC1Q9C099 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRCC1Q9C099 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRCC1Q9C099 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRCC1Q9C099 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRCC1Q9C099 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRCC1Q9C099 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRCC1Q9C099 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRCC1Q9C099 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRCC1Q9C099 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRCC1Q9C099 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRCC1Q9C099 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRCC1Q9C099 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRCC1Q9C099 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRCC1Q9C099 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRCC1Q9C099 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRCC1Q9C099 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRCC1Q9C099 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRCC1Q9C099 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRCC1Q9C099 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRCC1Q9C099 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRCC1Q9C099 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRCC1Q9C099 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRCC1Q9C099 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRCC1Q9C099 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRCC1Q9C099 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRCC1Q9C099 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRCC1Q9C099 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRCC1Q9C099 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRCC1Q9C099 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRCC1Q9C099 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRCC1Q9C099 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRCC1Q9C099 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRCC1Q9C099 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRCC1Q9C099 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRCC1Q9C099 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRCC1Q9C099 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRCC1Q9C099 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRCC1Q9C099 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRCC1Q9C099 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRCC1Q9C099 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRCC1Q9C099 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRCC1Q9C099 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRCC1Q9C099 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRCC1Q9C099 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRCC1Q9C099 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRCC1Q9C099 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRCC1Q9C099 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRCC1Q9C099 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRCC1Q9C099 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRCC1Q9C099 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRCC1Q9C099 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRCC1Q9C099 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRCC1Q9C099 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRCC1Q9C099 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRCC1Q9C099 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRCC1Q9C099 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRCC1Q9C099 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRCC1Q9C099 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRCC1Q9C099 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRCC1Q9C099 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRCC1Q9C099 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRCC1Q9C099 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRCC1Q9C099 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRCC1Q9C099 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms