Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ76

CNTNAP3, Contactin-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP3Q9BZ76 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTNAP3Q9BZ76 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTNAP3Q9BZ76 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTNAP3Q9BZ76 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTNAP3Q9BZ76 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTNAP3Q9BZ76 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTNAP3Q9BZ76 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTNAP3Q9BZ76 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTNAP3Q9BZ76 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTNAP3Q9BZ76 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTNAP3Q9BZ76 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTNAP3Q9BZ76 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTNAP3Q9BZ76 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTNAP3Q9BZ76 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTNAP3Q9BZ76 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNTNAP3Q9BZ76 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTNAP3Q9BZ76 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTNAP3Q9BZ76 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTNAP3Q9BZ76 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTNAP3Q9BZ76 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTNAP3Q9BZ76 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTNAP3Q9BZ76 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTNAP3Q9BZ76 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTNAP3Q9BZ76 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTNAP3Q9BZ76 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTNAP3Q9BZ76 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTNAP3Q9BZ76 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTNAP3Q9BZ76 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTNAP3Q9BZ76 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTNAP3Q9BZ76 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTNAP3Q9BZ76 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTNAP3Q9BZ76 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTNAP3Q9BZ76 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTNAP3Q9BZ76 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTNAP3Q9BZ76 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTNAP3Q9BZ76 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTNAP3Q9BZ76 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTNAP3Q9BZ76 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTNAP3Q9BZ76 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTNAP3Q9BZ76 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTNAP3Q9BZ76 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTNAP3Q9BZ76 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTNAP3Q9BZ76 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTNAP3Q9BZ76 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTNAP3Q9BZ76 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTNAP3Q9BZ76 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTNAP3Q9BZ76 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTNAP3Q9BZ76 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTNAP3Q9BZ76 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTNAP3Q9BZ76 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTNAP3Q9BZ76 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTNAP3Q9BZ76 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNTNAP3Q9BZ76 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNTNAP3Q9BZ76 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNTNAP3Q9BZ76 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNTNAP3Q9BZ76 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNTNAP3Q9BZ76 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNTNAP3Q9BZ76 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNTNAP3Q9BZ76 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNTNAP3Q9BZ76 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNTNAP3Q9BZ76 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNTNAP3Q9BZ76 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNTNAP3Q9BZ76 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNTNAP3Q9BZ76 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNTNAP3Q9BZ76 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNTNAP3Q9BZ76 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNTNAP3Q9BZ76 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNTNAP3Q9BZ76 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNTNAP3Q9BZ76 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNTNAP3Q9BZ76 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNTNAP3Q9BZ76 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNTNAP3Q9BZ76 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNTNAP3Q9BZ76 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNTNAP3Q9BZ76 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNTNAP3Q9BZ76 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNTNAP3Q9BZ76 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNTNAP3Q9BZ76 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CNTNAP3Q9BZ76 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNTNAP3Q9BZ76 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNTNAP3Q9BZ76 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNTNAP3Q9BZ76 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNTNAP3Q9BZ76 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CNTNAP3Q9BZ76 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CNTNAP3Q9BZ76 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CNTNAP3Q9BZ76 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CNTNAP3Q9BZ76 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CNTNAP3Q9BZ76 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
CNTNAP3Q9BZ76 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CNTNAP3Q9BZ76 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
CNTNAP3Q9BZ76 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNTNAP3Q9BZ76 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNTNAP3Q9BZ76 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNTNAP3Q9BZ76 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNTNAP3Q9BZ76 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNTNAP3Q9BZ76 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNTNAP3Q9BZ76 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNTNAP3Q9BZ76 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNTNAP3Q9BZ76 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNTNAP3Q9BZ76 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNTNAP3Q9BZ76 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms