Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY07

SLC4A5, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A5Q9BY07 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC4A5Q9BY07 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC4A5Q9BY07 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC4A5Q9BY07 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC4A5Q9BY07 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC4A5Q9BY07 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC4A5Q9BY07 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC4A5Q9BY07 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC4A5Q9BY07 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC4A5Q9BY07 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC4A5Q9BY07 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC4A5Q9BY07 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC4A5Q9BY07 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC4A5Q9BY07 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC4A5Q9BY07 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC4A5Q9BY07 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC4A5Q9BY07 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC4A5Q9BY07 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC4A5Q9BY07 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC4A5Q9BY07 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC4A5Q9BY07 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC4A5Q9BY07 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC4A5Q9BY07 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC4A5Q9BY07 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC4A5Q9BY07 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC4A5Q9BY07 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC4A5Q9BY07 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC4A5Q9BY07 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC4A5Q9BY07 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC4A5Q9BY07 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC4A5Q9BY07 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC4A5Q9BY07 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC4A5Q9BY07 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC4A5Q9BY07 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC4A5Q9BY07 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC4A5Q9BY07 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC4A5Q9BY07 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC4A5Q9BY07 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC4A5Q9BY07 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC4A5Q9BY07 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms