Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWC9

CCDC106, Coiled-coil domain-containing protein 106, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC106Q9BWC9 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC106Q9BWC9 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC106Q9BWC9 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC106Q9BWC9 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC106Q9BWC9 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC106Q9BWC9 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC106Q9BWC9 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC106Q9BWC9 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC106Q9BWC9 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC106Q9BWC9 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC106Q9BWC9 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC106Q9BWC9 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC106Q9BWC9 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC106Q9BWC9 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC106Q9BWC9 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC106Q9BWC9 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC106Q9BWC9 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC106Q9BWC9 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC106Q9BWC9 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC106Q9BWC9 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC106Q9BWC9 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC106Q9BWC9 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC106Q9BWC9 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC106Q9BWC9 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC106Q9BWC9 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC106Q9BWC9 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC106Q9BWC9 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC106Q9BWC9 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC106Q9BWC9 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC106Q9BWC9 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC106Q9BWC9 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC106Q9BWC9 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC106Q9BWC9 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC106Q9BWC9 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC106Q9BWC9 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC106Q9BWC9 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC106Q9BWC9 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC106Q9BWC9 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC106Q9BWC9 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC106Q9BWC9 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC106Q9BWC9 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC106Q9BWC9 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC106Q9BWC9 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC106Q9BWC9 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC106Q9BWC9 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC106Q9BWC9 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
CCDC106Q9BWC9 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CCDC106Q9BWC9 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
CCDC106Q9BWC9 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CCDC106Q9BWC9 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CCDC106Q9BWC9 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
CCDC106Q9BWC9 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.3
CCDC106Q9BWC9 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC106Q9BWC9 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC106Q9BWC9 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC106Q9BWC9 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC106Q9BWC9 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC106Q9BWC9 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC106Q9BWC9 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC106Q9BWC9 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC106Q9BWC9 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC106Q9BWC9 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC106Q9BWC9 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC106Q9BWC9 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC106Q9BWC9 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC106Q9BWC9 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC106Q9BWC9 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC106Q9BWC9 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC106Q9BWC9 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC106Q9BWC9 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC106Q9BWC9 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC106Q9BWC9 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC106Q9BWC9 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC106Q9BWC9 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC106Q9BWC9 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC106Q9BWC9 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC106Q9BWC9 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC106Q9BWC9 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC106Q9BWC9 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC106Q9BWC9 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC106Q9BWC9 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC106Q9BWC9 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC106Q9BWC9 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC106Q9BWC9 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC106Q9BWC9 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC106Q9BWC9 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC106Q9BWC9 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC106Q9BWC9 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC106Q9BWC9 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC106Q9BWC9 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC106Q9BWC9 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC106Q9BWC9 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC106Q9BWC9 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC106Q9BWC9 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC106Q9BWC9 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC106Q9BWC9 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC106Q9BWC9 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC106Q9BWC9 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC106Q9BWC9 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC106Q9BWC9 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms