Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HIRIP3Q9BW71 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HIRIP3Q9BW71 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HIRIP3Q9BW71 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HIRIP3Q9BW71 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HIRIP3Q9BW71 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HIRIP3Q9BW71 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HIRIP3Q9BW71 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HIRIP3Q9BW71 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HIRIP3Q9BW71 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HIRIP3Q9BW71 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HIRIP3Q9BW71 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HIRIP3Q9BW71 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HIRIP3Q9BW71 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
HIRIP3Q9BW71 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HIRIP3Q9BW71 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HIRIP3Q9BW71 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HIRIP3Q9BW71 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HIRIP3Q9BW71 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HIRIP3Q9BW71 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HIRIP3Q9BW71 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HIRIP3Q9BW71 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HIRIP3Q9BW71 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
HIRIP3Q9BW71 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HIRIP3Q9BW71 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HIRIP3Q9BW71 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HIRIP3Q9BW71 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HIRIP3Q9BW71 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HIRIP3Q9BW71 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HIRIP3Q9BW71 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HIRIP3Q9BW71 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HIRIP3Q9BW71 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HIRIP3Q9BW71 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HIRIP3Q9BW71 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HIRIP3Q9BW71 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
HIRIP3Q9BW71 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HIRIP3Q9BW71 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HIRIP3Q9BW71 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HIRIP3Q9BW71 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HIRIP3Q9BW71 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HIRIP3Q9BW71 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HIRIP3Q9BW71 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HIRIP3Q9BW71 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
HIRIP3Q9BW71 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HIRIP3Q9BW71 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HIRIP3Q9BW71 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HIRIP3Q9BW71 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HIRIP3Q9BW71 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HIRIP3Q9BW71 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HIRIP3Q9BW71 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HIRIP3Q9BW71 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HIRIP3Q9BW71 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HIRIP3Q9BW71 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HIRIP3Q9BW71 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HIRIP3Q9BW71 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HIRIP3Q9BW71 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HIRIP3Q9BW71 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HIRIP3Q9BW71 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HIRIP3Q9BW71 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
HIRIP3Q9BW71 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HIRIP3Q9BW71 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HIRIP3Q9BW71 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HIRIP3Q9BW71 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HIRIP3Q9BW71 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HIRIP3Q9BW71 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
HIRIP3Q9BW71 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
HIRIP3Q9BW71 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
HIRIP3Q9BW71 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HIRIP3Q9BW71 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HIRIP3Q9BW71 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HIRIP3Q9BW71 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HIRIP3Q9BW71 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HIRIP3Q9BW71 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HIRIP3Q9BW71 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HIRIP3Q9BW71 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HIRIP3Q9BW71 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HIRIP3Q9BW71 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HIRIP3Q9BW71 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HIRIP3Q9BW71 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HIRIP3Q9BW71 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HIRIP3Q9BW71 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HIRIP3Q9BW71 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HIRIP3Q9BW71 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HIRIP3Q9BW71 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HIRIP3Q9BW71 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HIRIP3Q9BW71 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HIRIP3Q9BW71 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HIRIP3Q9BW71 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
HIRIP3Q9BW71 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HIRIP3Q9BW71 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HIRIP3Q9BW71 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HIRIP3Q9BW71 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HIRIP3Q9BW71 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
HIRIP3Q9BW71 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HIRIP3Q9BW71 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HIRIP3Q9BW71 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
HIRIP3Q9BW71 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
HIRIP3Q9BW71 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
HIRIP3Q9BW71 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
HIRIP3Q9BW71 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms