Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTF0

THUMPD2, THUMP domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD2Q9BTF0 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
THUMPD2Q9BTF0 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
THUMPD2Q9BTF0 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
THUMPD2Q9BTF0 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
THUMPD2Q9BTF0 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
THUMPD2Q9BTF0 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
THUMPD2Q9BTF0 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
THUMPD2Q9BTF0 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
THUMPD2Q9BTF0 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
THUMPD2Q9BTF0 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
THUMPD2Q9BTF0 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
THUMPD2Q9BTF0 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
THUMPD2Q9BTF0 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
THUMPD2Q9BTF0 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
THUMPD2Q9BTF0 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
THUMPD2Q9BTF0 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
THUMPD2Q9BTF0 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
THUMPD2Q9BTF0 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
THUMPD2Q9BTF0 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
THUMPD2Q9BTF0 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
THUMPD2Q9BTF0 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
THUMPD2Q9BTF0 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
THUMPD2Q9BTF0 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
THUMPD2Q9BTF0 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
THUMPD2Q9BTF0 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
THUMPD2Q9BTF0 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
THUMPD2Q9BTF0 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
THUMPD2Q9BTF0 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
THUMPD2Q9BTF0 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
THUMPD2Q9BTF0 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
THUMPD2Q9BTF0 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
THUMPD2Q9BTF0 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
THUMPD2Q9BTF0 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
THUMPD2Q9BTF0 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
THUMPD2Q9BTF0 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
THUMPD2Q9BTF0 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
THUMPD2Q9BTF0 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
THUMPD2Q9BTF0 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
THUMPD2Q9BTF0 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
THUMPD2Q9BTF0 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
THUMPD2Q9BTF0 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
THUMPD2Q9BTF0 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
THUMPD2Q9BTF0 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
THUMPD2Q9BTF0 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
THUMPD2Q9BTF0 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
THUMPD2Q9BTF0 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
THUMPD2Q9BTF0 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
THUMPD2Q9BTF0 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
THUMPD2Q9BTF0 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
THUMPD2Q9BTF0 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
THUMPD2Q9BTF0 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
THUMPD2Q9BTF0 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
THUMPD2Q9BTF0 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
THUMPD2Q9BTF0 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
THUMPD2Q9BTF0 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
THUMPD2Q9BTF0 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
THUMPD2Q9BTF0 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
THUMPD2Q9BTF0 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
THUMPD2Q9BTF0 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
THUMPD2Q9BTF0 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
THUMPD2Q9BTF0 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
THUMPD2Q9BTF0 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
THUMPD2Q9BTF0 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
THUMPD2Q9BTF0 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
THUMPD2Q9BTF0 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
THUMPD2Q9BTF0 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
THUMPD2Q9BTF0 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
THUMPD2Q9BTF0 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
THUMPD2Q9BTF0 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
THUMPD2Q9BTF0 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
THUMPD2Q9BTF0 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
THUMPD2Q9BTF0 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
THUMPD2Q9BTF0 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
THUMPD2Q9BTF0 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
THUMPD2Q9BTF0 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
THUMPD2Q9BTF0 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
THUMPD2Q9BTF0 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
THUMPD2Q9BTF0 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
THUMPD2Q9BTF0 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
THUMPD2Q9BTF0 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
THUMPD2Q9BTF0 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
THUMPD2Q9BTF0 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
THUMPD2Q9BTF0 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
THUMPD2Q9BTF0 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
THUMPD2Q9BTF0 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
THUMPD2Q9BTF0 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
THUMPD2Q9BTF0 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
THUMPD2Q9BTF0 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
THUMPD2Q9BTF0 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
THUMPD2Q9BTF0 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
THUMPD2Q9BTF0 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
THUMPD2Q9BTF0 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
THUMPD2Q9BTF0 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
THUMPD2Q9BTF0 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
THUMPD2Q9BTF0 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
THUMPD2Q9BTF0 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
THUMPD2Q9BTF0 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
THUMPD2Q9BTF0 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
THUMPD2Q9BTF0 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
THUMPD2Q9BTF0 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms