Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL7

SEC22C, Vesicle-trafficking protein SEC22c, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22CQ9BRL7 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEC22CQ9BRL7 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEC22CQ9BRL7 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEC22CQ9BRL7 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEC22CQ9BRL7 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEC22CQ9BRL7 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEC22CQ9BRL7 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEC22CQ9BRL7 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEC22CQ9BRL7 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEC22CQ9BRL7 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEC22CQ9BRL7 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEC22CQ9BRL7 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEC22CQ9BRL7 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEC22CQ9BRL7 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEC22CQ9BRL7 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEC22CQ9BRL7 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEC22CQ9BRL7 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEC22CQ9BRL7 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEC22CQ9BRL7 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEC22CQ9BRL7 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEC22CQ9BRL7 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SEC22CQ9BRL7 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEC22CQ9BRL7 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEC22CQ9BRL7 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEC22CQ9BRL7 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEC22CQ9BRL7 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEC22CQ9BRL7 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEC22CQ9BRL7 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEC22CQ9BRL7 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEC22CQ9BRL7 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEC22CQ9BRL7 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEC22CQ9BRL7 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEC22CQ9BRL7 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEC22CQ9BRL7 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEC22CQ9BRL7 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEC22CQ9BRL7 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEC22CQ9BRL7 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEC22CQ9BRL7 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEC22CQ9BRL7 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEC22CQ9BRL7 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEC22CQ9BRL7 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEC22CQ9BRL7 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEC22CQ9BRL7 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEC22CQ9BRL7 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEC22CQ9BRL7 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEC22CQ9BRL7 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEC22CQ9BRL7 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEC22CQ9BRL7 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEC22CQ9BRL7 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEC22CQ9BRL7 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEC22CQ9BRL7 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEC22CQ9BRL7 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SEC22CQ9BRL7 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEC22CQ9BRL7 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEC22CQ9BRL7 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SEC22CQ9BRL7 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEC22CQ9BRL7 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEC22CQ9BRL7 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEC22CQ9BRL7 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEC22CQ9BRL7 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEC22CQ9BRL7 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEC22CQ9BRL7 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SEC22CQ9BRL7 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEC22CQ9BRL7 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEC22CQ9BRL7 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEC22CQ9BRL7 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEC22CQ9BRL7 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEC22CQ9BRL7 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEC22CQ9BRL7 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEC22CQ9BRL7 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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SEC22CQ9BRL7 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEC22CQ9BRL7 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEC22CQ9BRL7 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEC22CQ9BRL7 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEC22CQ9BRL7 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEC22CQ9BRL7 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEC22CQ9BRL7 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEC22CQ9BRL7 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEC22CQ9BRL7 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEC22CQ9BRL7 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEC22CQ9BRL7 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEC22CQ9BRL7 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEC22CQ9BRL7 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEC22CQ9BRL7 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEC22CQ9BRL7 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEC22CQ9BRL7 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEC22CQ9BRL7 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEC22CQ9BRL7 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEC22CQ9BRL7 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEC22CQ9BRL7 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEC22CQ9BRL7 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEC22CQ9BRL7 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEC22CQ9BRL7 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEC22CQ9BRL7 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEC22CQ9BRL7 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEC22CQ9BRL7 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SEC22CQ9BRL7 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SEC22CQ9BRL7 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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