Protein–RNA interactions for Protein: Q96G01

BICD1, Protein bicaudal D homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BICD1Q96G01 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BICD1Q96G01 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms