Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC97Q96F63 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC97Q96F63 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC97Q96F63 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC97Q96F63 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC97Q96F63 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC97Q96F63 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC97Q96F63 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC97Q96F63 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC97Q96F63 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC97Q96F63 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC97Q96F63 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC97Q96F63 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC97Q96F63 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC97Q96F63 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC97Q96F63 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC97Q96F63 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC97Q96F63 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC97Q96F63 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC97Q96F63 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC97Q96F63 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC97Q96F63 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC97Q96F63 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC97Q96F63 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC97Q96F63 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC97Q96F63 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC97Q96F63 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC97Q96F63 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC97Q96F63 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC97Q96F63 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC97Q96F63 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC97Q96F63 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC97Q96F63 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC97Q96F63 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC97Q96F63 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC97Q96F63 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC97Q96F63 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC97Q96F63 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC97Q96F63 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC97Q96F63 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC97Q96F63 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC97Q96F63 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC97Q96F63 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC97Q96F63 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC97Q96F63 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC97Q96F63 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC97Q96F63 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC97Q96F63 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC97Q96F63 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC97Q96F63 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC97Q96F63 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC97Q96F63 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC97Q96F63 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC97Q96F63 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC97Q96F63 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC97Q96F63 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC97Q96F63 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC97Q96F63 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC97Q96F63 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC97Q96F63 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC97Q96F63 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC97Q96F63 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC97Q96F63 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC97Q96F63 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC97Q96F63 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC97Q96F63 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC97Q96F63 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC97Q96F63 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC97Q96F63 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC97Q96F63 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC97Q96F63 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC97Q96F63 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC97Q96F63 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC97Q96F63 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC97Q96F63 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC97Q96F63 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC97Q96F63 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC97Q96F63 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC97Q96F63 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC97Q96F63 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC97Q96F63 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC97Q96F63 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC97Q96F63 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC97Q96F63 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC97Q96F63 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC97Q96F63 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC97Q96F63 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC97Q96F63 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC97Q96F63 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC97Q96F63 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC97Q96F63 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC97Q96F63 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC97Q96F63 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC97Q96F63 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC97Q96F63 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC97Q96F63 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC97Q96F63 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC97Q96F63 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC97Q96F63 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC97Q96F63 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.5 ms