Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms