Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SIRT1Q96EB6 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SIRT1Q96EB6 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SIRT1Q96EB6 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SIRT1Q96EB6 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SIRT1Q96EB6 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SIRT1Q96EB6 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SIRT1Q96EB6 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SIRT1Q96EB6 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SIRT1Q96EB6 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SIRT1Q96EB6 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SIRT1Q96EB6 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SIRT1Q96EB6 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SIRT1Q96EB6 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SIRT1Q96EB6 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SIRT1Q96EB6 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SIRT1Q96EB6 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SIRT1Q96EB6 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SIRT1Q96EB6 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SIRT1Q96EB6 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SIRT1Q96EB6 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SIRT1Q96EB6 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SIRT1Q96EB6 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SIRT1Q96EB6 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SIRT1Q96EB6 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SIRT1Q96EB6 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SIRT1Q96EB6 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SIRT1Q96EB6 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SIRT1Q96EB6 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SIRT1Q96EB6 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SIRT1Q96EB6 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SIRT1Q96EB6 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SIRT1Q96EB6 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SIRT1Q96EB6 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SIRT1Q96EB6 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SIRT1Q96EB6 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SIRT1Q96EB6 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SIRT1Q96EB6 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SIRT1Q96EB6 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SIRT1Q96EB6 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SIRT1Q96EB6 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SIRT1Q96EB6 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SIRT1Q96EB6 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SIRT1Q96EB6 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SIRT1Q96EB6 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SIRT1Q96EB6 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SIRT1Q96EB6 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SIRT1Q96EB6 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SIRT1Q96EB6 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SIRT1Q96EB6 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SIRT1Q96EB6 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SIRT1Q96EB6 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SIRT1Q96EB6 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SIRT1Q96EB6 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SIRT1Q96EB6 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SIRT1Q96EB6 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SIRT1Q96EB6 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SIRT1Q96EB6 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SIRT1Q96EB6 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SIRT1Q96EB6 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SIRT1Q96EB6 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SIRT1Q96EB6 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SIRT1Q96EB6 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SIRT1Q96EB6 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SIRT1Q96EB6 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SIRT1Q96EB6 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SIRT1Q96EB6 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SIRT1Q96EB6 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SIRT1Q96EB6 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SIRT1Q96EB6 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SIRT1Q96EB6 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SIRT1Q96EB6 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SIRT1Q96EB6 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SIRT1Q96EB6 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SIRT1Q96EB6 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SIRT1Q96EB6 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SIRT1Q96EB6 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SIRT1Q96EB6 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SIRT1Q96EB6 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SIRT1Q96EB6 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SIRT1Q96EB6 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SIRT1Q96EB6 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SIRT1Q96EB6 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SIRT1Q96EB6 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SIRT1Q96EB6 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SIRT1Q96EB6 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SIRT1Q96EB6 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SIRT1Q96EB6 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SIRT1Q96EB6 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SIRT1Q96EB6 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SIRT1Q96EB6 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SIRT1Q96EB6 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SIRT1Q96EB6 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SIRT1Q96EB6 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SIRT1Q96EB6 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SIRT1Q96EB6 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SIRT1Q96EB6 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SIRT1Q96EB6 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SIRT1Q96EB6 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SIRT1Q96EB6 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms