Protein–RNA interactions for Protein: Q969K3

RNF34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF34Q969K3 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RNF34Q969K3 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RNF34Q969K3 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RNF34Q969K3 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RNF34Q969K3 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RNF34Q969K3 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RNF34Q969K3 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RNF34Q969K3 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RNF34Q969K3 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RNF34Q969K3 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RNF34Q969K3 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RNF34Q969K3 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RNF34Q969K3 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RNF34Q969K3 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RNF34Q969K3 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RNF34Q969K3 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RNF34Q969K3 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RNF34Q969K3 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RNF34Q969K3 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RNF34Q969K3 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RNF34Q969K3 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RNF34Q969K3 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RNF34Q969K3 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RNF34Q969K3 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RNF34Q969K3 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RNF34Q969K3 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RNF34Q969K3 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RNF34Q969K3 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RNF34Q969K3 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RNF34Q969K3 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RNF34Q969K3 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNF34Q969K3 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNF34Q969K3 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNF34Q969K3 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNF34Q969K3 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNF34Q969K3 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNF34Q969K3 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RNF34Q969K3 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNF34Q969K3 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNF34Q969K3 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNF34Q969K3 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNF34Q969K3 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNF34Q969K3 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNF34Q969K3 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RNF34Q969K3 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNF34Q969K3 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNF34Q969K3 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNF34Q969K3 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNF34Q969K3 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNF34Q969K3 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNF34Q969K3 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNF34Q969K3 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RNF34Q969K3 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RNF34Q969K3 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNF34Q969K3 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNF34Q969K3 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNF34Q969K3 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNF34Q969K3 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNF34Q969K3 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNF34Q969K3 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNF34Q969K3 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNF34Q969K3 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNF34Q969K3 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNF34Q969K3 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNF34Q969K3 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNF34Q969K3 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNF34Q969K3 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNF34Q969K3 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNF34Q969K3 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNF34Q969K3 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNF34Q969K3 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNF34Q969K3 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNF34Q969K3 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNF34Q969K3 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNF34Q969K3 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNF34Q969K3 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNF34Q969K3 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNF34Q969K3 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RNF34Q969K3 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNF34Q969K3 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNF34Q969K3 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNF34Q969K3 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNF34Q969K3 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNF34Q969K3 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNF34Q969K3 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNF34Q969K3 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RNF34Q969K3 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RNF34Q969K3 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNF34Q969K3 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNF34Q969K3 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNF34Q969K3 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNF34Q969K3 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNF34Q969K3 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNF34Q969K3 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNF34Q969K3 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNF34Q969K3 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNF34Q969K3 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNF34Q969K3 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNF34Q969K3 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNF34Q969K3 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms