Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HLA-CQ95604 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HLA-CQ95604 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HLA-CQ95604 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HLA-CQ95604 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HLA-CQ95604 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HLA-CQ95604 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HLA-CQ95604 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HLA-CQ95604 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HLA-CQ95604 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HLA-CQ95604 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HLA-CQ95604 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HLA-CQ95604 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HLA-CQ95604 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HLA-CQ95604 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HLA-CQ95604 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HLA-CQ95604 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HLA-CQ95604 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HLA-CQ95604 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HLA-CQ95604 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HLA-CQ95604 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HLA-CQ95604 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HLA-CQ95604 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HLA-CQ95604 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HLA-CQ95604 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HLA-CQ95604 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HLA-CQ95604 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HLA-CQ95604 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HLA-CQ95604 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HLA-CQ95604 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HLA-CQ95604 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
HLA-CQ95604 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HLA-CQ95604 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HLA-CQ95604 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HLA-CQ95604 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HLA-CQ95604 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HLA-CQ95604 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HLA-CQ95604 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HLA-CQ95604 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HLA-CQ95604 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HLA-CQ95604 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HLA-CQ95604 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HLA-CQ95604 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HLA-CQ95604 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
HLA-CQ95604 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HLA-CQ95604 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HLA-CQ95604 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HLA-CQ95604 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
HLA-CQ95604 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HLA-CQ95604 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
HLA-CQ95604 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HLA-CQ95604 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
HLA-CQ95604 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
HLA-CQ95604 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HLA-CQ95604 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HLA-CQ95604 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HLA-CQ95604 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
HLA-CQ95604 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HLA-CQ95604 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HLA-CQ95604 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HLA-CQ95604 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HLA-CQ95604 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HLA-CQ95604 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HLA-CQ95604 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HLA-CQ95604 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HLA-CQ95604 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HLA-CQ95604 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HLA-CQ95604 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HLA-CQ95604 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HLA-CQ95604 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HLA-CQ95604 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HLA-CQ95604 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HLA-CQ95604 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HLA-CQ95604 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HLA-CQ95604 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HLA-CQ95604 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HLA-CQ95604 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HLA-CQ95604 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HLA-CQ95604 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HLA-CQ95604 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HLA-CQ95604 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HLA-CQ95604 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HLA-CQ95604 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HLA-CQ95604 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HLA-CQ95604 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HLA-CQ95604 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HLA-CQ95604 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HLA-CQ95604 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
HLA-CQ95604 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HLA-CQ95604 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HLA-CQ95604 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HLA-CQ95604 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HLA-CQ95604 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HLA-CQ95604 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HLA-CQ95604 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HLA-CQ95604 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HLA-CQ95604 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HLA-CQ95604 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HLA-CQ95604 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HLA-CQ95604 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms