Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

Predictions only

Length 1,446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRUQ92729 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRUQ92729 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRUQ92729 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRUQ92729 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRUQ92729 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRUQ92729 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRUQ92729 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRUQ92729 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRUQ92729 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRUQ92729 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRUQ92729 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRUQ92729 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRUQ92729 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRUQ92729 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PTPRUQ92729 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PTPRUQ92729 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PTPRUQ92729 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRUQ92729 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRUQ92729 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRUQ92729 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRUQ92729 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRUQ92729 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRUQ92729 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRUQ92729 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRUQ92729 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRUQ92729 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRUQ92729 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRUQ92729 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRUQ92729 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRUQ92729 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRUQ92729 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRUQ92729 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRUQ92729 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRUQ92729 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRUQ92729 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRUQ92729 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRUQ92729 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRUQ92729 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRUQ92729 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRUQ92729 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRUQ92729 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRUQ92729 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRUQ92729 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRUQ92729 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRUQ92729 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRUQ92729 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRUQ92729 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRUQ92729 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRUQ92729 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRUQ92729 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRUQ92729 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRUQ92729 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRUQ92729 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRUQ92729 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRUQ92729 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRUQ92729 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRUQ92729 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRUQ92729 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRUQ92729 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRUQ92729 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRUQ92729 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRUQ92729 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRUQ92729 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRUQ92729 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRUQ92729 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRUQ92729 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRUQ92729 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRUQ92729 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRUQ92729 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRUQ92729 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRUQ92729 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRUQ92729 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRUQ92729 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRUQ92729 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRUQ92729 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRUQ92729 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRUQ92729 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRUQ92729 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRUQ92729 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRUQ92729 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRUQ92729 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRUQ92729 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRUQ92729 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRUQ92729 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRUQ92729 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRUQ92729 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRUQ92729 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRUQ92729 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRUQ92729 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRUQ92729 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRUQ92729 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRUQ92729 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRUQ92729 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRUQ92729 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRUQ92729 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRUQ92729 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRUQ92729 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRUQ92729 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRUQ92729 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms