Protein–RNA interactions for Protein: Q92629

SGCD, Delta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCDQ92629 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGCDQ92629 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGCDQ92629 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGCDQ92629 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SGCDQ92629 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGCDQ92629 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGCDQ92629 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGCDQ92629 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGCDQ92629 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGCDQ92629 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGCDQ92629 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGCDQ92629 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGCDQ92629 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGCDQ92629 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGCDQ92629 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGCDQ92629 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGCDQ92629 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGCDQ92629 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SGCDQ92629 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SGCDQ92629 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SGCDQ92629 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SGCDQ92629 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SGCDQ92629 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SGCDQ92629 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCDQ92629 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCDQ92629 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCDQ92629 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCDQ92629 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCDQ92629 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCDQ92629 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCDQ92629 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCDQ92629 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCDQ92629 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCDQ92629 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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SGCDQ92629 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCDQ92629 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCDQ92629 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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SGCDQ92629 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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SGCDQ92629 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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SGCDQ92629 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCDQ92629 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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SGCDQ92629 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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SGCDQ92629 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCDQ92629 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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SGCDQ92629 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCDQ92629 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCDQ92629 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCDQ92629 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCDQ92629 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCDQ92629 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCDQ92629 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCDQ92629 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCDQ92629 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCDQ92629 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCDQ92629 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCDQ92629 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCDQ92629 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCDQ92629 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCDQ92629 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCDQ92629 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCDQ92629 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCDQ92629 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCDQ92629 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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