Protein–RNA interactions for Protein: Q92546

RGP1, RAB6A-GEF complex partner protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGP1Q92546 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RGP1Q92546 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RGP1Q92546 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RGP1Q92546 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RGP1Q92546 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RGP1Q92546 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RGP1Q92546 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RGP1Q92546 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RGP1Q92546 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RGP1Q92546 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RGP1Q92546 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RGP1Q92546 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RGP1Q92546 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RGP1Q92546 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RGP1Q92546 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RGP1Q92546 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RGP1Q92546 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RGP1Q92546 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RGP1Q92546 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RGP1Q92546 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RGP1Q92546 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RGP1Q92546 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms