Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC12Q8WUD4 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms