Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms