Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC112Q8NEF3 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms