Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7C7

RNF148, RING finger protein 148, humanhuman

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF148Q8N7C7 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RNF148Q8N7C7 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RNF148Q8N7C7 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RNF148Q8N7C7 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RNF148Q8N7C7 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RNF148Q8N7C7 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RNF148Q8N7C7 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RNF148Q8N7C7 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RNF148Q8N7C7 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RNF148Q8N7C7 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RNF148Q8N7C7 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RNF148Q8N7C7 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RNF148Q8N7C7 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RNF148Q8N7C7 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RNF148Q8N7C7 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RNF148Q8N7C7 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RNF148Q8N7C7 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RNF148Q8N7C7 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RNF148Q8N7C7 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RNF148Q8N7C7 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RNF148Q8N7C7 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RNF148Q8N7C7 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RNF148Q8N7C7 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNF148Q8N7C7 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNF148Q8N7C7 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNF148Q8N7C7 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNF148Q8N7C7 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNF148Q8N7C7 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNF148Q8N7C7 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNF148Q8N7C7 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNF148Q8N7C7 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNF148Q8N7C7 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNF148Q8N7C7 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNF148Q8N7C7 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNF148Q8N7C7 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNF148Q8N7C7 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNF148Q8N7C7 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNF148Q8N7C7 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNF148Q8N7C7 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNF148Q8N7C7 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RNF148Q8N7C7 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNF148Q8N7C7 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNF148Q8N7C7 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNF148Q8N7C7 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNF148Q8N7C7 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNF148Q8N7C7 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNF148Q8N7C7 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNF148Q8N7C7 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNF148Q8N7C7 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
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RNF148Q8N7C7 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RNF148Q8N7C7 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
RNF148Q8N7C7 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RNF148Q8N7C7 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RNF148Q8N7C7 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
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RNF148Q8N7C7 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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RNF148Q8N7C7 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF148Q8N7C7 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF148Q8N7C7 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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RNF148Q8N7C7 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF148Q8N7C7 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF148Q8N7C7 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF148Q8N7C7 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF148Q8N7C7 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF148Q8N7C7 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF148Q8N7C7 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF148Q8N7C7 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF148Q8N7C7 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF148Q8N7C7 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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RNF148Q8N7C7 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF148Q8N7C7 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF148Q8N7C7 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF148Q8N7C7 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF148Q8N7C7 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF148Q8N7C7 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RNF148Q8N7C7 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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