Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6Y2

LRRC17, Leucine-rich repeat-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC17Q8N6Y2 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRC17Q8N6Y2 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC17Q8N6Y2 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms