Protein–RNA interactions for Protein: Q8N205

SYNE4, Nesprin-4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4Q8N205 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYNE4Q8N205 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYNE4Q8N205 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYNE4Q8N205 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYNE4Q8N205 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYNE4Q8N205 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYNE4Q8N205 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SYNE4Q8N205 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYNE4Q8N205 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYNE4Q8N205 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYNE4Q8N205 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SYNE4Q8N205 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYNE4Q8N205 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYNE4Q8N205 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYNE4Q8N205 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYNE4Q8N205 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYNE4Q8N205 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SYNE4Q8N205 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SYNE4Q8N205 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SYNE4Q8N205 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYNE4Q8N205 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYNE4Q8N205 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SYNE4Q8N205 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYNE4Q8N205 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYNE4Q8N205 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYNE4Q8N205 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYNE4Q8N205 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYNE4Q8N205 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYNE4Q8N205 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYNE4Q8N205 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYNE4Q8N205 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYNE4Q8N205 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYNE4Q8N205 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYNE4Q8N205 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYNE4Q8N205 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYNE4Q8N205 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYNE4Q8N205 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYNE4Q8N205 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYNE4Q8N205 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYNE4Q8N205 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYNE4Q8N205 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SYNE4Q8N205 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYNE4Q8N205 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYNE4Q8N205 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYNE4Q8N205 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SYNE4Q8N205 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYNE4Q8N205 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYNE4Q8N205 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYNE4Q8N205 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYNE4Q8N205 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYNE4Q8N205 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYNE4Q8N205 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYNE4Q8N205 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYNE4Q8N205 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYNE4Q8N205 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYNE4Q8N205 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYNE4Q8N205 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYNE4Q8N205 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYNE4Q8N205 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYNE4Q8N205 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYNE4Q8N205 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYNE4Q8N205 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYNE4Q8N205 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SYNE4Q8N205 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYNE4Q8N205 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SYNE4Q8N205 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYNE4Q8N205 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYNE4Q8N205 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYNE4Q8N205 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYNE4Q8N205 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SYNE4Q8N205 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYNE4Q8N205 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYNE4Q8N205 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYNE4Q8N205 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYNE4Q8N205 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYNE4Q8N205 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYNE4Q8N205 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYNE4Q8N205 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SYNE4Q8N205 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYNE4Q8N205 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYNE4Q8N205 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYNE4Q8N205 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SYNE4Q8N205 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SYNE4Q8N205 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SYNE4Q8N205 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SYNE4Q8N205 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SYNE4Q8N205 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYNE4Q8N205 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYNE4Q8N205 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYNE4Q8N205 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYNE4Q8N205 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYNE4Q8N205 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYNE4Q8N205 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYNE4Q8N205 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYNE4Q8N205 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYNE4Q8N205 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYNE4Q8N205 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYNE4Q8N205 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYNE4Q8N205 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYNE4Q8N205 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
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