Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPAP2Q8IXW5 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms