Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVM0

CCDC50, Coiled-coil domain-containing protein 50, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC50Q8IVM0 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC50Q8IVM0 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC50Q8IVM0 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC50Q8IVM0 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC50Q8IVM0 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC50Q8IVM0 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC50Q8IVM0 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC50Q8IVM0 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC50Q8IVM0 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC50Q8IVM0 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC50Q8IVM0 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC50Q8IVM0 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC50Q8IVM0 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC50Q8IVM0 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC50Q8IVM0 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC50Q8IVM0 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC50Q8IVM0 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC50Q8IVM0 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC50Q8IVM0 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC50Q8IVM0 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC50Q8IVM0 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC50Q8IVM0 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC50Q8IVM0 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC50Q8IVM0 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC50Q8IVM0 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC50Q8IVM0 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC50Q8IVM0 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC50Q8IVM0 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC50Q8IVM0 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC50Q8IVM0 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC50Q8IVM0 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC50Q8IVM0 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC50Q8IVM0 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC50Q8IVM0 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC50Q8IVM0 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC50Q8IVM0 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC50Q8IVM0 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC50Q8IVM0 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC50Q8IVM0 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC50Q8IVM0 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC50Q8IVM0 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC50Q8IVM0 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC50Q8IVM0 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC50Q8IVM0 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC50Q8IVM0 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC50Q8IVM0 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC50Q8IVM0 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC50Q8IVM0 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC50Q8IVM0 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC50Q8IVM0 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC50Q8IVM0 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC50Q8IVM0 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC50Q8IVM0 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC50Q8IVM0 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC50Q8IVM0 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC50Q8IVM0 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC50Q8IVM0 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC50Q8IVM0 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC50Q8IVM0 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC50Q8IVM0 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC50Q8IVM0 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC50Q8IVM0 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC50Q8IVM0 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC50Q8IVM0 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC50Q8IVM0 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC50Q8IVM0 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC50Q8IVM0 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC50Q8IVM0 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC50Q8IVM0 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC50Q8IVM0 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC50Q8IVM0 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC50Q8IVM0 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC50Q8IVM0 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC50Q8IVM0 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC50Q8IVM0 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC50Q8IVM0 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC50Q8IVM0 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC50Q8IVM0 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC50Q8IVM0 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC50Q8IVM0 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC50Q8IVM0 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC50Q8IVM0 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC50Q8IVM0 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC50Q8IVM0 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC50Q8IVM0 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC50Q8IVM0 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC50Q8IVM0 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC50Q8IVM0 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC50Q8IVM0 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC50Q8IVM0 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC50Q8IVM0 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC50Q8IVM0 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC50Q8IVM0 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC50Q8IVM0 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC50Q8IVM0 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC50Q8IVM0 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC50Q8IVM0 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC50Q8IVM0 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC50Q8IVM0 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC50Q8IVM0 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms