Protein–RNA interactions for Protein: Q86VB7

CD163, Scavenger receptor cysteine-rich type 1 protein M130, humanhuman

Predictions only

Length 1,156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD163Q86VB7 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD163Q86VB7 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD163Q86VB7 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD163Q86VB7 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD163Q86VB7 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD163Q86VB7 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD163Q86VB7 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD163Q86VB7 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD163Q86VB7 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD163Q86VB7 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CD163Q86VB7 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD163Q86VB7 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD163Q86VB7 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD163Q86VB7 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD163Q86VB7 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD163Q86VB7 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD163Q86VB7 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD163Q86VB7 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CD163Q86VB7 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD163Q86VB7 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CD163Q86VB7 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD163Q86VB7 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD163Q86VB7 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD163Q86VB7 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD163Q86VB7 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD163Q86VB7 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD163Q86VB7 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CD163Q86VB7 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CD163Q86VB7 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms