Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms