Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5D8

NANOGNB, NANOG neighbor homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGNBQ7Z5D8 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NANOGNBQ7Z5D8 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NANOGNBQ7Z5D8 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NANOGNBQ7Z5D8 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NANOGNBQ7Z5D8 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NANOGNBQ7Z5D8 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NANOGNBQ7Z5D8 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NANOGNBQ7Z5D8 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NANOGNBQ7Z5D8 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NANOGNBQ7Z5D8 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NANOGNBQ7Z5D8 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NANOGNBQ7Z5D8 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NANOGNBQ7Z5D8 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NANOGNBQ7Z5D8 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NANOGNBQ7Z5D8 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NANOGNBQ7Z5D8 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NANOGNBQ7Z5D8 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NANOGNBQ7Z5D8 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NANOGNBQ7Z5D8 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NANOGNBQ7Z5D8 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NANOGNBQ7Z5D8 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NANOGNBQ7Z5D8 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NANOGNBQ7Z5D8 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NANOGNBQ7Z5D8 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NANOGNBQ7Z5D8 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NANOGNBQ7Z5D8 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NANOGNBQ7Z5D8 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NANOGNBQ7Z5D8 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NANOGNBQ7Z5D8 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NANOGNBQ7Z5D8 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NANOGNBQ7Z5D8 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NANOGNBQ7Z5D8 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NANOGNBQ7Z5D8 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NANOGNBQ7Z5D8 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NANOGNBQ7Z5D8 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NANOGNBQ7Z5D8 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NANOGNBQ7Z5D8 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NANOGNBQ7Z5D8 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NANOGNBQ7Z5D8 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NANOGNBQ7Z5D8 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NANOGNBQ7Z5D8 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NANOGNBQ7Z5D8 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NANOGNBQ7Z5D8 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NANOGNBQ7Z5D8 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NANOGNBQ7Z5D8 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NANOGNBQ7Z5D8 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NANOGNBQ7Z5D8 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NANOGNBQ7Z5D8 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NANOGNBQ7Z5D8 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NANOGNBQ7Z5D8 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NANOGNBQ7Z5D8 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NANOGNBQ7Z5D8 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NANOGNBQ7Z5D8 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NANOGNBQ7Z5D8 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NANOGNBQ7Z5D8 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NANOGNBQ7Z5D8 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NANOGNBQ7Z5D8 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NANOGNBQ7Z5D8 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NANOGNBQ7Z5D8 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NANOGNBQ7Z5D8 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NANOGNBQ7Z5D8 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NANOGNBQ7Z5D8 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NANOGNBQ7Z5D8 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NANOGNBQ7Z5D8 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NANOGNBQ7Z5D8 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NANOGNBQ7Z5D8 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NANOGNBQ7Z5D8 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NANOGNBQ7Z5D8 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NANOGNBQ7Z5D8 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NANOGNBQ7Z5D8 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NANOGNBQ7Z5D8 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NANOGNBQ7Z5D8 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NANOGNBQ7Z5D8 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NANOGNBQ7Z5D8 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NANOGNBQ7Z5D8 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NANOGNBQ7Z5D8 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NANOGNBQ7Z5D8 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NANOGNBQ7Z5D8 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NANOGNBQ7Z5D8 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NANOGNBQ7Z5D8 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NANOGNBQ7Z5D8 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NANOGNBQ7Z5D8 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NANOGNBQ7Z5D8 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NANOGNBQ7Z5D8 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NANOGNBQ7Z5D8 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NANOGNBQ7Z5D8 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NANOGNBQ7Z5D8 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NANOGNBQ7Z5D8 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NANOGNBQ7Z5D8 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NANOGNBQ7Z5D8 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NANOGNBQ7Z5D8 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NANOGNBQ7Z5D8 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NANOGNBQ7Z5D8 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NANOGNBQ7Z5D8 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NANOGNBQ7Z5D8 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NANOGNBQ7Z5D8 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NANOGNBQ7Z5D8 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NANOGNBQ7Z5D8 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NANOGNBQ7Z5D8 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NANOGNBQ7Z5D8 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms