Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FOXD4L3Q6VB84 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FOXD4L3Q6VB84 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FOXD4L3Q6VB84 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FOXD4L3Q6VB84 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FOXD4L3Q6VB84 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FOXD4L3Q6VB84 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FOXD4L3Q6VB84 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FOXD4L3Q6VB84 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FOXD4L3Q6VB84 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FOXD4L3Q6VB84 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
FOXD4L3Q6VB84 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
FOXD4L3Q6VB84 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
FOXD4L3Q6VB84 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
FOXD4L3Q6VB84 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
FOXD4L3Q6VB84 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
FOXD4L3Q6VB84 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms