Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms