Protein–RNA interactions for Protein: Q6U736

OPN5, Opsin-5, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN5Q6U736 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OPN5Q6U736 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OPN5Q6U736 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OPN5Q6U736 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
OPN5Q6U736 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OPN5Q6U736 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OPN5Q6U736 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OPN5Q6U736 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OPN5Q6U736 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
OPN5Q6U736 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
OPN5Q6U736 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
OPN5Q6U736 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
OPN5Q6U736 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
OPN5Q6U736 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
OPN5Q6U736 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
OPN5Q6U736 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
OPN5Q6U736 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
OPN5Q6U736 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
OPN5Q6U736 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
OPN5Q6U736 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
OPN5Q6U736 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
OPN5Q6U736 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
OPN5Q6U736 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
OPN5Q6U736 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
OPN5Q6U736 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
OPN5Q6U736 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
OPN5Q6U736 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
OPN5Q6U736 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
OPN5Q6U736 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
OPN5Q6U736 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
OPN5Q6U736 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
OPN5Q6U736 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
OPN5Q6U736 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
OPN5Q6U736 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
OPN5Q6U736 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
OPN5Q6U736 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
OPN5Q6U736 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
OPN5Q6U736 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
OPN5Q6U736 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
OPN5Q6U736 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
OPN5Q6U736 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
OPN5Q6U736 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OPN5Q6U736 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
OPN5Q6U736 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
OPN5Q6U736 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
OPN5Q6U736 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
OPN5Q6U736 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OPN5Q6U736 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
OPN5Q6U736 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
OPN5Q6U736 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
OPN5Q6U736 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OPN5Q6U736 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
OPN5Q6U736 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OPN5Q6U736 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
OPN5Q6U736 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
OPN5Q6U736 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OPN5Q6U736 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
OPN5Q6U736 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
OPN5Q6U736 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
OPN5Q6U736 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
OPN5Q6U736 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
OPN5Q6U736 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
OPN5Q6U736 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
OPN5Q6U736 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
OPN5Q6U736 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
OPN5Q6U736 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
OPN5Q6U736 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
OPN5Q6U736 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
OPN5Q6U736 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OPN5Q6U736 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OPN5Q6U736 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
OPN5Q6U736 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OPN5Q6U736 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
OPN5Q6U736 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OPN5Q6U736 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OPN5Q6U736 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OPN5Q6U736 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
OPN5Q6U736 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OPN5Q6U736 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OPN5Q6U736 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
OPN5Q6U736 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OPN5Q6U736 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OPN5Q6U736 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
OPN5Q6U736 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OPN5Q6U736 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
OPN5Q6U736 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OPN5Q6U736 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OPN5Q6U736 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OPN5Q6U736 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OPN5Q6U736 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
OPN5Q6U736 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OPN5Q6U736 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OPN5Q6U736 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC16■□□□□ 0.15
OPN5Q6U736 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
OPN5Q6U736 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
OPN5Q6U736 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16■□□□□ 0.15
OPN5Q6U736 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
OPN5Q6U736 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
OPN5Q6U736 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OPN5Q6U736 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms