Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDB4

ZNF880, Zinc finger protein 880, humanhuman

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Length 577 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF880Q6PDB4 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF880Q6PDB4 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF880Q6PDB4 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF880Q6PDB4 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF880Q6PDB4 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF880Q6PDB4 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF880Q6PDB4 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF880Q6PDB4 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF880Q6PDB4 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF880Q6PDB4 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF880Q6PDB4 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF880Q6PDB4 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF880Q6PDB4 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF880Q6PDB4 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF880Q6PDB4 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF880Q6PDB4 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF880Q6PDB4 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF880Q6PDB4 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF880Q6PDB4 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF880Q6PDB4 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF880Q6PDB4 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF880Q6PDB4 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF880Q6PDB4 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF880Q6PDB4 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF880Q6PDB4 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF880Q6PDB4 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF880Q6PDB4 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF880Q6PDB4 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF880Q6PDB4 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF880Q6PDB4 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF880Q6PDB4 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF880Q6PDB4 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF880Q6PDB4 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF880Q6PDB4 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF880Q6PDB4 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF880Q6PDB4 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF880Q6PDB4 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF880Q6PDB4 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF880Q6PDB4 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF880Q6PDB4 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF880Q6PDB4 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF880Q6PDB4 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF880Q6PDB4 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF880Q6PDB4 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF880Q6PDB4 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF880Q6PDB4 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF880Q6PDB4 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF880Q6PDB4 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF880Q6PDB4 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF880Q6PDB4 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF880Q6PDB4 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF880Q6PDB4 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF880Q6PDB4 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF880Q6PDB4 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF880Q6PDB4 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF880Q6PDB4 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF880Q6PDB4 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF880Q6PDB4 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF880Q6PDB4 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF880Q6PDB4 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF880Q6PDB4 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF880Q6PDB4 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF880Q6PDB4 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF880Q6PDB4 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF880Q6PDB4 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF880Q6PDB4 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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ZNF880Q6PDB4 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF880Q6PDB4 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF880Q6PDB4 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF880Q6PDB4 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF880Q6PDB4 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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ZNF880Q6PDB4 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF880Q6PDB4 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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ZNF880Q6PDB4 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF880Q6PDB4 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF880Q6PDB4 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF880Q6PDB4 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF880Q6PDB4 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF880Q6PDB4 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF880Q6PDB4 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF880Q6PDB4 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF880Q6PDB4 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF880Q6PDB4 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF880Q6PDB4 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF880Q6PDB4 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF880Q6PDB4 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF880Q6PDB4 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF880Q6PDB4 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF880Q6PDB4 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF880Q6PDB4 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF880Q6PDB4 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF880Q6PDB4 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF880Q6PDB4 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF880Q6PDB4 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF880Q6PDB4 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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