Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1M0

SLC27A4, Long-chain fatty acid transport protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A4Q6P1M0 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC27A4Q6P1M0 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms