Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT76

HMBOX1, Homeobox-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMBOX1Q6NT76 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HMBOX1Q6NT76 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms