Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPU0

CENPP, Centromere protein P, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPPQ6IPU0 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CENPPQ6IPU0 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CENPPQ6IPU0 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CENPPQ6IPU0 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CENPPQ6IPU0 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CENPPQ6IPU0 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CENPPQ6IPU0 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CENPPQ6IPU0 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CENPPQ6IPU0 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CENPPQ6IPU0 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CENPPQ6IPU0 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CENPPQ6IPU0 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CENPPQ6IPU0 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CENPPQ6IPU0 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CENPPQ6IPU0 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CENPPQ6IPU0 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CENPPQ6IPU0 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CENPPQ6IPU0 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CENPPQ6IPU0 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CENPPQ6IPU0 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CENPPQ6IPU0 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CENPPQ6IPU0 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CENPPQ6IPU0 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CENPPQ6IPU0 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CENPPQ6IPU0 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CENPPQ6IPU0 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CENPPQ6IPU0 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CENPPQ6IPU0 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CENPPQ6IPU0 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CENPPQ6IPU0 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CENPPQ6IPU0 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CENPPQ6IPU0 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CENPPQ6IPU0 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CENPPQ6IPU0 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CENPPQ6IPU0 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CENPPQ6IPU0 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CENPPQ6IPU0 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CENPPQ6IPU0 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CENPPQ6IPU0 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CENPPQ6IPU0 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CENPPQ6IPU0 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CENPPQ6IPU0 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CENPPQ6IPU0 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CENPPQ6IPU0 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CENPPQ6IPU0 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CENPPQ6IPU0 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CENPPQ6IPU0 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CENPPQ6IPU0 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CENPPQ6IPU0 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CENPPQ6IPU0 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CENPPQ6IPU0 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CENPPQ6IPU0 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CENPPQ6IPU0 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CENPPQ6IPU0 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CENPPQ6IPU0 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CENPPQ6IPU0 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CENPPQ6IPU0 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CENPPQ6IPU0 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CENPPQ6IPU0 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CENPPQ6IPU0 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CENPPQ6IPU0 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CENPPQ6IPU0 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CENPPQ6IPU0 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CENPPQ6IPU0 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CENPPQ6IPU0 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CENPPQ6IPU0 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CENPPQ6IPU0 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CENPPQ6IPU0 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CENPPQ6IPU0 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CENPPQ6IPU0 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CENPPQ6IPU0 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CENPPQ6IPU0 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CENPPQ6IPU0 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CENPPQ6IPU0 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CENPPQ6IPU0 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CENPPQ6IPU0 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CENPPQ6IPU0 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CENPPQ6IPU0 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CENPPQ6IPU0 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CENPPQ6IPU0 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CENPPQ6IPU0 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CENPPQ6IPU0 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CENPPQ6IPU0 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CENPPQ6IPU0 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CENPPQ6IPU0 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CENPPQ6IPU0 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CENPPQ6IPU0 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CENPPQ6IPU0 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CENPPQ6IPU0 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CENPPQ6IPU0 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CENPPQ6IPU0 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CENPPQ6IPU0 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CENPPQ6IPU0 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CENPPQ6IPU0 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CENPPQ6IPU0 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CENPPQ6IPU0 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CENPPQ6IPU0 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CENPPQ6IPU0 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CENPPQ6IPU0 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CENPPQ6IPU0 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms