Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI14

SLC9A4, Sodium/hydrogen exchanger 4, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A4Q6AI14 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC9A4Q6AI14 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC9A4Q6AI14 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC9A4Q6AI14 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC9A4Q6AI14 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC9A4Q6AI14 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC9A4Q6AI14 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC9A4Q6AI14 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC9A4Q6AI14 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC9A4Q6AI14 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC9A4Q6AI14 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC9A4Q6AI14 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC9A4Q6AI14 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC9A4Q6AI14 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC9A4Q6AI14 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC9A4Q6AI14 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC9A4Q6AI14 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC9A4Q6AI14 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC9A4Q6AI14 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC9A4Q6AI14 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC9A4Q6AI14 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC9A4Q6AI14 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC9A4Q6AI14 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC9A4Q6AI14 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC9A4Q6AI14 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC9A4Q6AI14 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC9A4Q6AI14 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC9A4Q6AI14 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC9A4Q6AI14 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC9A4Q6AI14 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC9A4Q6AI14 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC9A4Q6AI14 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC9A4Q6AI14 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC9A4Q6AI14 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC9A4Q6AI14 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC9A4Q6AI14 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC9A4Q6AI14 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC9A4Q6AI14 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC9A4Q6AI14 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC9A4Q6AI14 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC9A4Q6AI14 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC9A4Q6AI14 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC9A4Q6AI14 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC9A4Q6AI14 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC9A4Q6AI14 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC9A4Q6AI14 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC9A4Q6AI14 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC9A4Q6AI14 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC9A4Q6AI14 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC9A4Q6AI14 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC9A4Q6AI14 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC9A4Q6AI14 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC9A4Q6AI14 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC9A4Q6AI14 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC9A4Q6AI14 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC9A4Q6AI14 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC9A4Q6AI14 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC9A4Q6AI14 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC9A4Q6AI14 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC9A4Q6AI14 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC9A4Q6AI14 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC9A4Q6AI14 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC9A4Q6AI14 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC9A4Q6AI14 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC9A4Q6AI14 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC9A4Q6AI14 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC9A4Q6AI14 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC9A4Q6AI14 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC9A4Q6AI14 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC9A4Q6AI14 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC9A4Q6AI14 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC9A4Q6AI14 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC9A4Q6AI14 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC9A4Q6AI14 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC9A4Q6AI14 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC9A4Q6AI14 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC9A4Q6AI14 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC9A4Q6AI14 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC9A4Q6AI14 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC9A4Q6AI14 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC9A4Q6AI14 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC9A4Q6AI14 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC9A4Q6AI14 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC9A4Q6AI14 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC9A4Q6AI14 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC9A4Q6AI14 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC9A4Q6AI14 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC9A4Q6AI14 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC9A4Q6AI14 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC9A4Q6AI14 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC9A4Q6AI14 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC9A4Q6AI14 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC9A4Q6AI14 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC9A4Q6AI14 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC9A4Q6AI14 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC9A4Q6AI14 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC9A4Q6AI14 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC9A4Q6AI14 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC9A4Q6AI14 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC9A4Q6AI14 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms