Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW32

BROX, BRO1 domain-containing protein BROX, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BROXQ5VW32 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BROXQ5VW32 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BROXQ5VW32 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BROXQ5VW32 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BROXQ5VW32 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BROXQ5VW32 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BROXQ5VW32 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BROXQ5VW32 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BROXQ5VW32 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BROXQ5VW32 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
BROXQ5VW32 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BROXQ5VW32 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BROXQ5VW32 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BROXQ5VW32 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BROXQ5VW32 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BROXQ5VW32 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BROXQ5VW32 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BROXQ5VW32 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BROXQ5VW32 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BROXQ5VW32 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BROXQ5VW32 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BROXQ5VW32 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BROXQ5VW32 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BROXQ5VW32 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BROXQ5VW32 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BROXQ5VW32 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BROXQ5VW32 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BROXQ5VW32 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BROXQ5VW32 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BROXQ5VW32 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BROXQ5VW32 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BROXQ5VW32 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BROXQ5VW32 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
BROXQ5VW32 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
BROXQ5VW32 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BROXQ5VW32 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BROXQ5VW32 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BROXQ5VW32 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
BROXQ5VW32 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BROXQ5VW32 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BROXQ5VW32 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
BROXQ5VW32 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BROXQ5VW32 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
BROXQ5VW32 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BROXQ5VW32 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BROXQ5VW32 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BROXQ5VW32 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BROXQ5VW32 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BROXQ5VW32 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BROXQ5VW32 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BROXQ5VW32 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BROXQ5VW32 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BROXQ5VW32 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BROXQ5VW32 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BROXQ5VW32 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BROXQ5VW32 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BROXQ5VW32 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BROXQ5VW32 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BROXQ5VW32 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BROXQ5VW32 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BROXQ5VW32 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BROXQ5VW32 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BROXQ5VW32 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BROXQ5VW32 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BROXQ5VW32 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BROXQ5VW32 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BROXQ5VW32 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BROXQ5VW32 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BROXQ5VW32 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BROXQ5VW32 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BROXQ5VW32 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BROXQ5VW32 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BROXQ5VW32 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BROXQ5VW32 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BROXQ5VW32 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BROXQ5VW32 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BROXQ5VW32 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BROXQ5VW32 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
BROXQ5VW32 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BROXQ5VW32 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BROXQ5VW32 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BROXQ5VW32 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BROXQ5VW32 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BROXQ5VW32 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BROXQ5VW32 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BROXQ5VW32 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BROXQ5VW32 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BROXQ5VW32 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BROXQ5VW32 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BROXQ5VW32 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BROXQ5VW32 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BROXQ5VW32 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BROXQ5VW32 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BROXQ5VW32 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BROXQ5VW32 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BROXQ5VW32 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BROXQ5VW32 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BROXQ5VW32 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BROXQ5VW32 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BROXQ5VW32 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms