Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms