Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTL7

FNDC7, Fibronectin type III domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 733 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC7Q5VTL7 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FNDC7Q5VTL7 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FNDC7Q5VTL7 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FNDC7Q5VTL7 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FNDC7Q5VTL7 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FNDC7Q5VTL7 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FNDC7Q5VTL7 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FNDC7Q5VTL7 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FNDC7Q5VTL7 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FNDC7Q5VTL7 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FNDC7Q5VTL7 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FNDC7Q5VTL7 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FNDC7Q5VTL7 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FNDC7Q5VTL7 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FNDC7Q5VTL7 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FNDC7Q5VTL7 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FNDC7Q5VTL7 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FNDC7Q5VTL7 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FNDC7Q5VTL7 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FNDC7Q5VTL7 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FNDC7Q5VTL7 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
FNDC7Q5VTL7 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
FNDC7Q5VTL7 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
FNDC7Q5VTL7 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
FNDC7Q5VTL7 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
FNDC7Q5VTL7 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
FNDC7Q5VTL7 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
FNDC7Q5VTL7 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
FNDC7Q5VTL7 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
FNDC7Q5VTL7 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
FNDC7Q5VTL7 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNDC7Q5VTL7 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNDC7Q5VTL7 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNDC7Q5VTL7 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNDC7Q5VTL7 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNDC7Q5VTL7 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNDC7Q5VTL7 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNDC7Q5VTL7 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNDC7Q5VTL7 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNDC7Q5VTL7 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNDC7Q5VTL7 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNDC7Q5VTL7 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNDC7Q5VTL7 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNDC7Q5VTL7 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNDC7Q5VTL7 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNDC7Q5VTL7 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNDC7Q5VTL7 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNDC7Q5VTL7 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNDC7Q5VTL7 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNDC7Q5VTL7 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNDC7Q5VTL7 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNDC7Q5VTL7 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNDC7Q5VTL7 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNDC7Q5VTL7 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNDC7Q5VTL7 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNDC7Q5VTL7 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNDC7Q5VTL7 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
FNDC7Q5VTL7 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNDC7Q5VTL7 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNDC7Q5VTL7 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNDC7Q5VTL7 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNDC7Q5VTL7 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNDC7Q5VTL7 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
FNDC7Q5VTL7 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNDC7Q5VTL7 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNDC7Q5VTL7 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
FNDC7Q5VTL7 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
FNDC7Q5VTL7 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNDC7Q5VTL7 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNDC7Q5VTL7 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNDC7Q5VTL7 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNDC7Q5VTL7 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNDC7Q5VTL7 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNDC7Q5VTL7 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNDC7Q5VTL7 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNDC7Q5VTL7 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNDC7Q5VTL7 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FNDC7Q5VTL7 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
FNDC7Q5VTL7 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNDC7Q5VTL7 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNDC7Q5VTL7 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNDC7Q5VTL7 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNDC7Q5VTL7 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNDC7Q5VTL7 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNDC7Q5VTL7 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNDC7Q5VTL7 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNDC7Q5VTL7 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNDC7Q5VTL7 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNDC7Q5VTL7 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNDC7Q5VTL7 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNDC7Q5VTL7 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNDC7Q5VTL7 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNDC7Q5VTL7 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNDC7Q5VTL7 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNDC7Q5VTL7 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNDC7Q5VTL7 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNDC7Q5VTL7 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FNDC7Q5VTL7 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FNDC7Q5VTL7 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FNDC7Q5VTL7 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms