Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSD8

Putative uncharacterized protein LOC401522, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5VSD8 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q5VSD8 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q5VSD8 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q5VSD8 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q5VSD8 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q5VSD8 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q5VSD8 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q5VSD8 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q5VSD8 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q5VSD8 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q5VSD8 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q5VSD8 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q5VSD8 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q5VSD8 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q5VSD8 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q5VSD8 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Q5VSD8 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q5VSD8 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q5VSD8 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q5VSD8 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q5VSD8 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q5VSD8 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Q5VSD8 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q5VSD8 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q5VSD8 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q5VSD8 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q5VSD8 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Q5VSD8 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q5VSD8 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q5VSD8 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q5VSD8 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q5VSD8 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q5VSD8 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q5VSD8 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q5VSD8 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Q5VSD8 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q5VSD8 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q5VSD8 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Q5VSD8 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q5VSD8 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q5VSD8 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q5VSD8 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q5VSD8 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q5VSD8 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q5VSD8 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q5VSD8 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q5VSD8 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q5VSD8 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q5VSD8 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q5VSD8 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q5VSD8 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q5VSD8 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Q5VSD8 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q5VSD8 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q5VSD8 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q5VSD8 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q5VSD8 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q5VSD8 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q5VSD8 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q5VSD8 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q5VSD8 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q5VSD8 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q5VSD8 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q5VSD8 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q5VSD8 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q5VSD8 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q5VSD8 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q5VSD8 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q5VSD8 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q5VSD8 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Q5VSD8 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q5VSD8 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q5VSD8 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q5VSD8 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q5VSD8 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q5VSD8 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q5VSD8 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q5VSD8 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q5VSD8 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q5VSD8 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q5VSD8 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q5VSD8 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q5VSD8 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q5VSD8 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q5VSD8 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q5VSD8 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q5VSD8 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q5VSD8 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q5VSD8 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q5VSD8 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q5VSD8 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q5VSD8 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q5VSD8 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q5VSD8 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q5VSD8 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q5VSD8 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q5VSD8 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q5VSD8 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q5VSD8 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q5VSD8 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms