Protein–RNA interactions for Protein: Q5U3C3

TMEM164, Transmembrane protein 164, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM164Q5U3C3 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 KC6-207ENST00000600644 2311 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM164Q5U3C3 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms