Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK3

KCNT1, Potassium channel subfamily T member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT1Q5JUK3 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCNT1Q5JUK3 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCNT1Q5JUK3 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCNT1Q5JUK3 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCNT1Q5JUK3 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCNT1Q5JUK3 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCNT1Q5JUK3 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCNT1Q5JUK3 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCNT1Q5JUK3 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNT1Q5JUK3 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95 ms