Protein–RNA interactions for Protein: Q56UQ5

TPT1-like protein, humanhuman

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Length 140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q56UQ5 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q56UQ5 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q56UQ5 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Q56UQ5 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q56UQ5 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q56UQ5 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q56UQ5 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q56UQ5 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Q56UQ5 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q56UQ5 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q56UQ5 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q56UQ5 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q56UQ5 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q56UQ5 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q56UQ5 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q56UQ5 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q56UQ5 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Q56UQ5 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q56UQ5 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q56UQ5 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Q56UQ5 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q56UQ5 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q56UQ5 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q56UQ5 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q56UQ5 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q56UQ5 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q56UQ5 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q56UQ5 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q56UQ5 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q56UQ5 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q56UQ5 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q56UQ5 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q56UQ5 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q56UQ5 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q56UQ5 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q56UQ5 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q56UQ5 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q56UQ5 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q56UQ5 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Q56UQ5 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Q56UQ5 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Q56UQ5 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Q56UQ5 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q56UQ5 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q56UQ5 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q56UQ5 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q56UQ5 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q56UQ5 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Q56UQ5 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q56UQ5 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q56UQ5 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Q56UQ5 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Q56UQ5 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Q56UQ5 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q56UQ5 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q56UQ5 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Q56UQ5 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Q56UQ5 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q56UQ5 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q56UQ5 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Q56UQ5 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q56UQ5 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q56UQ5 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q56UQ5 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q56UQ5 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q56UQ5 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q56UQ5 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q56UQ5 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Q56UQ5 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Q56UQ5 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q56UQ5 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q56UQ5 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q56UQ5 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q56UQ5 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q56UQ5 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q56UQ5 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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