Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDCA8Q53HL2 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDCA8Q53HL2 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDCA8Q53HL2 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDCA8Q53HL2 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CDCA8Q53HL2 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDCA8Q53HL2 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDCA8Q53HL2 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDCA8Q53HL2 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDCA8Q53HL2 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDCA8Q53HL2 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDCA8Q53HL2 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDCA8Q53HL2 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDCA8Q53HL2 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDCA8Q53HL2 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDCA8Q53HL2 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDCA8Q53HL2 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDCA8Q53HL2 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDCA8Q53HL2 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDCA8Q53HL2 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDCA8Q53HL2 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDCA8Q53HL2 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDCA8Q53HL2 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDCA8Q53HL2 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDCA8Q53HL2 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDCA8Q53HL2 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDCA8Q53HL2 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDCA8Q53HL2 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDCA8Q53HL2 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDCA8Q53HL2 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDCA8Q53HL2 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDCA8Q53HL2 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDCA8Q53HL2 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDCA8Q53HL2 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDCA8Q53HL2 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDCA8Q53HL2 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDCA8Q53HL2 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDCA8Q53HL2 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CDCA8Q53HL2 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDCA8Q53HL2 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDCA8Q53HL2 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDCA8Q53HL2 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDCA8Q53HL2 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDCA8Q53HL2 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CDCA8Q53HL2 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDCA8Q53HL2 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDCA8Q53HL2 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDCA8Q53HL2 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDCA8Q53HL2 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDCA8Q53HL2 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDCA8Q53HL2 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDCA8Q53HL2 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDCA8Q53HL2 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDCA8Q53HL2 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDCA8Q53HL2 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDCA8Q53HL2 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDCA8Q53HL2 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDCA8Q53HL2 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDCA8Q53HL2 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CDCA8Q53HL2 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDCA8Q53HL2 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDCA8Q53HL2 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDCA8Q53HL2 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CDCA8Q53HL2 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CDCA8Q53HL2 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDCA8Q53HL2 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDCA8Q53HL2 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDCA8Q53HL2 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDCA8Q53HL2 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDCA8Q53HL2 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDCA8Q53HL2 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDCA8Q53HL2 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDCA8Q53HL2 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDCA8Q53HL2 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDCA8Q53HL2 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDCA8Q53HL2 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDCA8Q53HL2 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDCA8Q53HL2 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDCA8Q53HL2 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CDCA8Q53HL2 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CDCA8Q53HL2 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CDCA8Q53HL2 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CDCA8Q53HL2 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CDCA8Q53HL2 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDCA8Q53HL2 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDCA8Q53HL2 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDCA8Q53HL2 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDCA8Q53HL2 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CDCA8Q53HL2 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDCA8Q53HL2 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDCA8Q53HL2 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CDCA8Q53HL2 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDCA8Q53HL2 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDCA8Q53HL2 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDCA8Q53HL2 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDCA8Q53HL2 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDCA8Q53HL2 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDCA8Q53HL2 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDCA8Q53HL2 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDCA8Q53HL2 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms