Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL38Q2WGJ6 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms