Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2I5

KRT24, Keratin, type I cytoskeletal 24, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT24Q2M2I5 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT24Q2M2I5 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT24Q2M2I5 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT24Q2M2I5 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT24Q2M2I5 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT24Q2M2I5 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT24Q2M2I5 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT24Q2M2I5 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT24Q2M2I5 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT24Q2M2I5 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT24Q2M2I5 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT24Q2M2I5 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT24Q2M2I5 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT24Q2M2I5 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT24Q2M2I5 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT24Q2M2I5 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT24Q2M2I5 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT24Q2M2I5 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT24Q2M2I5 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT24Q2M2I5 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT24Q2M2I5 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT24Q2M2I5 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT24Q2M2I5 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT24Q2M2I5 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT24Q2M2I5 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT24Q2M2I5 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT24Q2M2I5 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT24Q2M2I5 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT24Q2M2I5 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT24Q2M2I5 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT24Q2M2I5 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT24Q2M2I5 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT24Q2M2I5 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT24Q2M2I5 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT24Q2M2I5 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT24Q2M2I5 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT24Q2M2I5 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT24Q2M2I5 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT24Q2M2I5 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT24Q2M2I5 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT24Q2M2I5 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT24Q2M2I5 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT24Q2M2I5 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT24Q2M2I5 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT24Q2M2I5 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT24Q2M2I5 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT24Q2M2I5 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT24Q2M2I5 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT24Q2M2I5 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT24Q2M2I5 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT24Q2M2I5 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT24Q2M2I5 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT24Q2M2I5 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT24Q2M2I5 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT24Q2M2I5 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT24Q2M2I5 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT24Q2M2I5 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT24Q2M2I5 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT24Q2M2I5 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT24Q2M2I5 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT24Q2M2I5 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT24Q2M2I5 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT24Q2M2I5 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT24Q2M2I5 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT24Q2M2I5 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT24Q2M2I5 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT24Q2M2I5 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT24Q2M2I5 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT24Q2M2I5 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT24Q2M2I5 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT24Q2M2I5 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT24Q2M2I5 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT24Q2M2I5 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT24Q2M2I5 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT24Q2M2I5 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT24Q2M2I5 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT24Q2M2I5 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT24Q2M2I5 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT24Q2M2I5 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT24Q2M2I5 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT24Q2M2I5 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT24Q2M2I5 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT24Q2M2I5 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT24Q2M2I5 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT24Q2M2I5 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT24Q2M2I5 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT24Q2M2I5 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT24Q2M2I5 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT24Q2M2I5 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT24Q2M2I5 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT24Q2M2I5 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT24Q2M2I5 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT24Q2M2I5 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT24Q2M2I5 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT24Q2M2I5 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT24Q2M2I5 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT24Q2M2I5 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT24Q2M2I5 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT24Q2M2I5 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT24Q2M2I5 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms