Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Q1T7F1 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Q1T7F1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Q1T7F1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Q1T7F1 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Q1T7F1 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Q1T7F1 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Q1T7F1 EFR3B-205ENST00000405108 2432 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Q1T7F1 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Q1T7F1 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Q1T7F1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Q1T7F1 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Q1T7F1 LHFPL2-201ENST00000380345 5043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Q1T7F1 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Q1T7F1 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Q1T7F1 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Q1T7F1 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Q1T7F1 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Q1T7F1 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Q1T7F1 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Q1T7F1 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Q1T7F1 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Q1T7F1 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Q1T7F1 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Q1T7F1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Q1T7F1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Q1T7F1 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Q1T7F1 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Q1T7F1 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Q1T7F1 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Q1T7F1 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Q1T7F1 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Q1T7F1 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Q1T7F1 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Q1T7F1 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Q1T7F1 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Q1T7F1 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Q1T7F1 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Q1T7F1 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Q1T7F1 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Q1T7F1 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Q1T7F1 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Q1T7F1 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Q1T7F1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Q1T7F1 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Q1T7F1 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Q1T7F1 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Q1T7F1 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Q1T7F1 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Q1T7F1 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Q1T7F1 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Q1T7F1 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Q1T7F1 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Q1T7F1 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Q1T7F1 RNH1-224ENST00000534797 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Q1T7F1 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Q1T7F1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Q1T7F1 C12orf43-202ENST00000445832 2397 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Q1T7F1 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Q1T7F1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Q1T7F1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Q1T7F1 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Q1T7F1 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Q1T7F1 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Q1T7F1 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Q1T7F1 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Q1T7F1 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Q1T7F1 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Q1T7F1 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Q1T7F1 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Q1T7F1 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Q1T7F1 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Q1T7F1 USH1G-202ENST00000614341 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Q1T7F1 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Q1T7F1 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Q1T7F1 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Q1T7F1 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Q1T7F1 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Q1T7F1 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Q1T7F1 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Q1T7F1 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Q1T7F1 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Q1T7F1 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Q1T7F1 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Q1T7F1 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Q1T7F1 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Q1T7F1 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Q1T7F1 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Q1T7F1 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Q1T7F1 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Q1T7F1 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Q1T7F1 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Q1T7F1 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Q1T7F1 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Q1T7F1 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Q1T7F1 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Q1T7F1 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Q1T7F1 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Q1T7F1 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Q1T7F1 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC9.25□□□□□ -0.93
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